6.2 Sequenzen, die im Sequenzprotokoll aufgeführt werden müssen
6.2.4 Der Qualifier "mol_type"
Der Merkmalschlüssel "source" ist neben den Qualifiern "organism" und "mol_type" obligatorisch für jede Sequenz (Absatz 75 des WIPO-Standards ST.26).
Der Qualifier-Wert "mol_type" muss aus einer Liste vorgegebener Begriffe ausgewählt werden, die in Anhang I des WIPO-Standards ST.26 definiert (Abschnitt 6, Qualifier mol_type 6.39; Abschnitt 8, Qualifier mol_type 8.1) und in der nachstehenden Tabelle dargestellt sind:
DNA |
RNA |
AA |
|---|---|---|
genomic DNA other DNA unassigned DNA |
genomic RNA mRNA tRNA rRNA transcribed RNA viral cRNA other RNA unassigned RNA |
protein |
Der Wert "genomic DNA" impliziert nicht, dass es sich um ein Zellkernmolekül handel (so müssen z. B. Organell- und Plasmid-DNA mit dem Wert "genomic DNA" beschrieben werden).
Ribosomale RNA-Gene müssen anhand von "genomic DNA" beschrieben werden.
Der Wert "rRNA" darf nur verwendet werden, wenn das ribosomale RNA-Molekül selbst sequenziert wurde.
Die Werte "other RNA" und "other DNA" müssen für synthetische Moleküle verwendet werden, d. h. für Moleküle, die künstlich erzeugt wurden.
Die Werte "unassigned DNA" und "unassigned RNA" müssen dagegen für Moleküle verwendet werden, die von einem Organismus isoliert wurden, deren Natur aber nicht bekannt oder nicht offenbart ist und die keinem präziseren Qualifier-Wert zugewiesen werden können (z. B. wenn nicht bekannt ist, ob die Sequenz eine tRNA oder eine mRNA oder eine andere Art von natürlicher RNA ist).