6.2 Sequenzen, die im Sequenzprotokoll aufgeführt werden müssen
Beschreibt die Anmeldung Sequenzvarianten, z. B. "Nukleotide 90-179 von SEQ ID No. 1 werden deletiert oder durch eine andere Sequenz substituiert", so ist Absatz 95 des WIPO-Standards ST.26 anzuwenden, dem zufolge diese Varianten durch eine Annotation zur Primärsequenz dargestellt werden sollten. Es handelt sich um eine Empfehlung, die nicht verpflichtend ist, solange die spezifische Sequenzvariante als solche in der Anmeldung nicht durch Aufzählung darstellt ist.
Entscheidet sich der Anmelder dafür, diese Angaben in das Sequenzprotokoll aufzunehmen, sind die nachstehenden Regeln aus Absatz 95 von ST.26 zu befolgen:
a)die Variante kann durch eine Annotation zur Primärsequenz dargestellt werden, wenn sie Variationen an einer einzigen oder mehreren unterschiedlichen Stellen enthält und diese Variationen unabhängig voneinander auftreten,
b)die Variante sollte als gesonderte Sequenz dargestellt und mit einer eigenen Sequenzkennzahl versehen werden, wenn sie Variationen an mehreren unterschiedlichen Stellen enthält und diese Variationen in wechselseitiger Abhängigkeit auftreten, und
c)die Variante muss als gesonderte Sequenz dargestellt und mit einer eigenen Sequenzkennzahl versehen werden, wenn sie eine eingefügte (Insertion) oder ersetzte (Substitution) Sequenz aus mehr als 1000 Resten enthält.
Die folgende Tabelle zeigt, welche Merkmalschlüssel und Qualifier verwendet werden sollten, um die Varianten je nach Art der Sequenz und der Variation zu annotieren (siehe Absatz 96 des WIPO-Standards ST.26).
Art der Sequenz |
Merkmalschlüssel |
Qualifier |
Verwendung |
---|---|---|---|
Nukleinsäure |
Variation |
replace oder note |
Natürlich vorkommende Mutationen und Polymorphismen, z. B. Allele, RFLPs |
Nukleinsäure |
misc_difference |
replace oder note |
Variabilität, die künstlich eingeführt wird, z. B. durch genetische Manipulation oder chemische Synthese |
Aminosäure |
VAR_SEQ |
note |
Variante, die durch alternatives Spleißen, alternative Promotoren, alternative Initiierung und ribosomale Leserasterverschiebung erzeugt wird |
Aminosäure |
VARIANT |
note |
Jede Art von Variante, für die VAR_SEQ nicht anwendbar ist |