6.2 Séquences devant être détaillées dans le listage de séquences
6.2.4 Le qualificateur "mol_type"
La clé de caractérisation "source" est obligatoire pour chaque séquence et doit être accompagnée des qualificateurs "organism" et "mol_type" (paragraphe 75 de la norme ST.26 de l'OMPI).
La valeur du qualificateur "mol_type" doit être sélectionnée à partir d'une liste de termes prédéterminés tels que définis à l'annexe I de la norme ST.26 de l'OMPI (section 6, qualificateur mol_type 6.39 ; section 8, qualificateur mol_type 8.1) et qu'indiqués dans le tableau suivant :
DNA |
RNA |
AA |
|---|---|---|
genomic DNA other DNA unassigned DNA |
genomic RNA mRNA tRNA rRNA transcribed RNA viral cRNA other RNA unassigned RNA |
protein |
La valeur "genomic DNA" n'implique pas que la molécule soit nucléaire (par exemple l'organite et l'ADN plasmidique doivent être décrits à l'aide de "genomic DNA").
Les gènes d'ARN ribosomique doivent être décrits à l'aide de "genomic DNA".
La valeur "rRNA" ne doit être utilisée que si la molécule d'ARN ribosomique a été séquencée.
Les valeurs "other RNA" et "other DNA" doivent être appliquées aux molécules de synthèse, à savoir aux molécules créées artificiellement.
En revanche, les valeurs "unassigned DNA" et "unassigned RNA" doivent être utilisées pour les molécules qui ont été isolées d'un organisme mais dont la nature n'est pas connue ou n'est pas divulguée et qui ne peuvent pas se voir attribuer une valeur plus précise de qualificateur (par exemple si l'on ignore si la séquence est un ARNt, un ARNm ou un autre type d'ARN naturel).